Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNF544Q6NX49 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms