Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
UFSP1Q6NVU6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms