Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
INTS3Q68E01 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
INTS3Q68E01 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms