Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
AGAP9Q5VTM2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms