Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms