Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC183Q5T5S1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms