Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PCID2Q5JVF3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PCID2Q5JVF3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms