Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LACTB2Q53H82 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms