Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HSD17B12Q53GQ0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms