Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0T1

Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SCART1, humanhuman

Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4G0T1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q4G0T1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q4G0T1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q4G0T1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q4G0T1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q4G0T1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q4G0T1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q4G0T1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q4G0T1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q4G0T1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q4G0T1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q4G0T1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q4G0T1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q4G0T1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q4G0T1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q4G0T1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q4G0T1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Q4G0T1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q4G0T1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Q4G0T1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Q4G0T1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Q4G0T1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q4G0T1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q4G0T1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q4G0T1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q4G0T1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q4G0T1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q4G0T1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q4G0T1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q4G0T1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q4G0T1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q4G0T1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q4G0T1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q4G0T1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q4G0T1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q4G0T1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Q4G0T1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms