Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LONRF3Q496Y0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LONRF3Q496Y0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms