Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTLL9Q3SXZ7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms