Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms