Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NBPF1Q3BBV0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NBPF1Q3BBV0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms