Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP5B1Q2VPB7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms