Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL40Q2TBA0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL40Q2TBA0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms