Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL24A1Q17RW2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
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