Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RTL8BQ17RB0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RTL8BQ17RB0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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