Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCK2Q16822 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms