Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDKN3Q16667 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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