Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LAMA4Q16363 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA4Q16363 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
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