Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCBQ16143 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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