Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GRIK4Q16099 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GRIK4Q16099 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms