Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ITSN1Q15811 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITSN1Q15811 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms