Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SEC23BQ15437 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SEC23BQ15437 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms