Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.61e-7■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 ANPEP-203ENST00000558740 573 ntTSL 213.01□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 RPL17-214ENST00000582588 401 ntTSL 22.57□□□□□ -27e-10■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 ASAP3-204ENST00000465372 936 ntTSL 514.56□□□□□ -0.084e-12■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 EEF2-205ENST00000598436 549 ntTSL 211.5□□□□□ -0.572e-19■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.192e-47■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 B4GALT3-209ENST00000486938 308 ntTSL 26.4□□□□□ -1.381e-9■■■■■ 31.5
SF3B4Q15427 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.313e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 TBC1D9B-216ENST00000522224 532 ntTSL 516.69■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 LSS-209ENST00000484808 251 ntTSL 514.99□□□□□ -0.012e-32■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.233e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.483e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 OGT-203ENST00000444774 556 ntTSL 49.94□□□□□ -0.823e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 OGT-208ENST00000472270 689 ntTSL 26.01□□□□□ -1.453e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 SMARCD2-210ENST00000584400 1017 ntTSL 324.8■■□□□ 1.567e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.847e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.837e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.487e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.17e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 STXBP2-206ENST00000594221 747 ntTSL 313.89□□□□□ -0.198e-18■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 TAOK2-205ENST00000566552 2372 ntTSL 217.63■□□□□ 0.414e-10■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 HMBS-204ENST00000534956 547 ntTSL 55.16□□□□□ -1.587e-15■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 SGSM3-204ENST00000457767 1086 ntTSL 212.79□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.413e-6■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 PITRM1-202ENST00000380989 3487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 PTK7-215ENST00000487673 5282 ntTSL 213.53□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 PTK7-208ENST00000470019 4016 ntTSL 513.3□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 PTK7-201ENST00000230418 3958 ntTSL 1 (best)13.07□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 PTK7-213ENST00000481273 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 TMEM94-218ENST00000581252 522 ntTSL 510.65□□□□□ -0.74e-11■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 TMEM94-208ENST00000578853 905 ntTSL 313.62□□□□□ -0.234e-8■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 OSBPL2-202ENST00000358053 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 CES1-207ENST00000565568 659 ntTSL 513.8□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 CES1-209ENST00000569260 499 ntTSL 54.29□□□□□ -1.722e-6■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.562e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.352e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.022e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.422e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 RNF166-205ENST00000562544 502 ntTSL 515.26■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.693e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 GPCPD1-207ENST00000633552 571 ntTSL 54.37□□□□□ -1.716e-8■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 GPCPD1-202ENST00000418646 4015 ntTSL 54.22□□□□□ -1.736e-8■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.355e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.015e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.035e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.385e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.425e-9■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 TBK1-202ENST00000536906 756 ntTSL 55.45□□□□□ -1.542e-6■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.435e-10■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 ANGEL2-202ENST00000366962 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.765e-10■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.35e-10■■■■■ 31.4
SF3B4Q15427 IL17RC-223ENST00000478206 597 ntTSL 1 (best)12□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 FLOT2-207ENST00000581509 426 ntTSL 215.79■□□□□ 0.124e-9■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 TMEM94-232ENST00000585105 5632 ntTSL 213.49□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 TMEM94-217ENST00000581085 5432 ntTSL 211.81□□□□□ -0.523e-8■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 TMEM94-209ENST00000579208 3543 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 TMEM94-202ENST00000375248 4703 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.783e-8■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 CCNG2-203ENST00000497512 2051 ntTSL 1 (best)24.26■■□□□ 1.477e-11■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.087e-11■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.67e-11■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 NUDT22-206ENST00000535000 1071 ntTSL 218.52■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 NUDT22-210ENST00000543358 659 ntTSL 318.14■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 NUDT22-203ENST00000428347 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.8■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 FAM13B-209ENST00000510804 582 ntTSL 215.59■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 PSMC4-204ENST00000596386 929 ntTSL 214.34□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 MED24-224ENST00000580720 549 ntTSL 313.7□□□□□ -0.224e-8■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 ZNF384-213ENST00000542519 797 ntTSL 1 (best)13.42□□□□□ -0.264e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 NUDT22-211ENST00000543501 475 ntTSL 213.15□□□□□ -0.34e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 CCNG2-206ENST00000512918 578 ntTSL 212.72□□□□□ -0.377e-11■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 FAM13B-207ENST00000508403 530 ntTSL 212.34□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.457e-11■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 NUDT22-212ENST00000545184 581 ntTSL 411.05□□□□□ -0.644e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 CYB5B-204ENST00000515314 1658 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.784e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 NUDT22-207ENST00000537094 475 ntTSL 29.18□□□□□ -0.944e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 FAM13B-206ENST00000505961 529 ntTSL 58.43□□□□□ -1.064e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 FAM13B-211ENST00000514310 669 ntTSL 48.07□□□□□ -1.124e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 CYB5B-202ENST00000512062 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.124e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 CCNG2-205ENST00000509972 1549 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.227e-11■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 CYB5B-205ENST00000561792 823 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.234e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.394e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 FAM13B-208ENST00000509596 590 ntTSL 45.18□□□□□ -1.584e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 FAM13B-204ENST00000502471 572 ntTSL 45.13□□□□□ -1.594e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 PDE8A-214ENST00000561024 2601 ntTSL 1 (best)4.73□□□□□ -1.654e-6■■■■■ 31.3
SF3B4Q15427 CYB5B-206ENST00000568237 577 ntTSL 54.19□□□□□ -1.744e-6■■■■■ 31.3
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