Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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RABEP1Q15276 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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RABEP1Q15276 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABEP1Q15276 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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