Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDCD1Q15116 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDCD1Q15116 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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