Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCOLCEQ15113 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCOLCEQ15113 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
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