Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRAM2Q15035 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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