Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CLCA4Q14CN2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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