Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSHL1Q14406 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSHL1Q14406 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSHL1Q14406 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms