Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM53BQ14153 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms