Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCARB2Q14108 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SCARB2Q14108 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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