Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTCH1Q13635 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
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