Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IRF5Q13568 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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IRF5Q13568 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF5Q13568 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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