Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TCIRG1Q13488 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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