Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PMS2P3Q13401 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PMS2P3Q13401 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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