Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PSMC6-216ENST00000557557 2939 ntTSL 27.72□□□□□ -1.176e-13■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 PSMC6-217ENST00000557632 611 ntTSL 27.69□□□□□ -1.186e-13■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 RPS9-211ENST00000484121 897 ntTSL 216.49■□□□□ 0.233e-18■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.023e-18■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 METTL13-204ENST00000466643 841 ntTSL 217.91■□□□□ 0.462e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 METTL13-205ENST00000476386 283 ntTSL 33□□□□□ -1.932e-6■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.162e-20■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.162e-20■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.152e-20■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 GNAS-234ENST00000477931 1663 ntTSL 1 (best)27.66■■■□□ 2.022e-20■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.692e-20■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 GNAS-238ENST00000480975 1534 ntTSL 523.07■■□□□ 1.282e-20■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.092e-20■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 GNAS-222ENST00000464624 3764 ntTSL 515.27■□□□□ 0.032e-20■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.212e-20■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 GNAS-245ENST00000487862 1782 ntTSL 213.09□□□□□ -0.312e-20■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 GNAS-232ENST00000476196 1839 ntTSL 212.55□□□□□ -0.42e-20■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 GNAS-208ENST00000371075 2551 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.552e-20■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 GNAS-204ENST00000313949 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.632e-20■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 GNAS-255ENST00000496934 2837 ntTSL 27.76□□□□□ -1.172e-20■■■□□ 19.1
PABPC4Q13310 MCRS1-208ENST00000548646 608 ntTSL 319.71■□□□□ 0.753e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 MCRS1-212ENST00000551598 636 ntTSL 519.71■□□□□ 0.753e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 MCRS1-213ENST00000551625 2450 ntTSL 1 (best)17.89■□□□□ 0.453e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 MCRS1-215ENST00000552596 669 ntTSL 216.81■□□□□ 0.283e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 MCRS1-207ENST00000548602 1666 ntTSL 1 (best)16.23■□□□□ 0.193e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.193e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.153e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.063e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ISOC2-207ENST00000590921 2283 ntTSL 220.55■□□□□ 0.884e-10■■■□□ 19
PABPC4Q13310 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.134e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.974e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.394e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NAPRT-201ENST00000340490 1774 ntTSL 1 (best)27.65■■■□□ 2.023e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.533e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NAPRT-207ENST00000464332 1212 ntTSL 221.97■■□□□ 1.113e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.113e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 13e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NAPRT-213ENST00000529179 454 ntTSL 220.16■□□□□ 0.823e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NAPRT-211ENST00000498076 448 ntTSL 219.09■□□□□ 0.653e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NAPRT-205ENST00000460623 694 ntTSL 317.72■□□□□ 0.433e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.198e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 PSMD13-210ENST00000529679 507 ntTSL 210.97□□□□□ -0.652e-10■■■□□ 19
PABPC4Q13310 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.117e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.247e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.483e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.333e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 LEF1-204ENST00000503879 1492 ntTSL 37.02□□□□□ -1.293e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 LEF1-205ENST00000504426 1479 ntTSL 36.77□□□□□ -1.333e-6■■■□□ 19
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PABPC4Q13310 QARS-209ENST00000464962 2362 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.425e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 QARS-247ENST00000636018 2171 ntTSL 511.85□□□□□ -0.515e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 QARS-250ENST00000637281 1327 ntTSL 58.49□□□□□ -1.055e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.141e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 MRPL24-201ENST00000361531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.141e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.932e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.552e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.492e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GUK1-212ENST00000435153 865 ntTSL 315.06■□□□□ 02e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.697e-10■■■□□ 19
PABPC4Q13310 PRADC1-203ENST00000480093 600 ntTSL 529.23■■■□□ 2.273e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.893e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 RPL13-203ENST00000399461 879 ntTSL 226.8■■□□□ 1.884e-42■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 23e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.283e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 LINC02210-202ENST00000455565 2609 ntTSL 1 (best)26.97■■□□□ 1.912e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 LINC02210-CRHR1-202ENST00000634540 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.262e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 LINC02210-213ENST00000591271 9678 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.812e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 LINC02210-CRHR1-201ENST00000587305 560 ntTSL 57.38□□□□□ -1.232e-7■■■□□ 19
PABPC4Q13310 MYL4-210ENST00000576874 641 ntTSL 312.13□□□□□ -0.473e-12■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ELF2-209ENST00000511184 1766 ntTSL 532.12■■■□□ 2.732e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.123e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 HDDC3-203ENST00000494993 1220 ntTSL 227.04■■□□□ 1.925e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.45■■□□□ 1.662e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ALKBH6-217ENST00000497999 725 ntTSL 525.34■■□□□ 1.652e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 DRAP1-207ENST00000531121 672 ntTSL 325.3■■□□□ 1.649e-15■■■□□ 19
PABPC4Q13310 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.596e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.542e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GPR108-211ENST00000597706 1834 ntTSL 524.45■■□□□ 1.55e-18■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NDUFAF8-206ENST00000577158 278 ntTSL 1 (best)24.39■■□□□ 1.492e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.346e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.345e-18■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ALKBH6-216ENST00000495116 630 ntTSL 223.36■■□□□ 1.332e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ALKBH6-204ENST00000461668 793 ntTSL 523.22■■□□□ 1.312e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.282e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.265e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.222e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 TMEM161A-204ENST00000587096 1065 ntTSL 522.21■■□□□ 1.156e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.045e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.026e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.023e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 TMEM222-208ENST00000486082 994 ntTSL 320.82■□□□□ 0.929e-15■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.92e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.92e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 APIP-202ENST00000527830 1042 ntTSL 220.49■□□□□ 0.872e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.856e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.856e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NTRK1-205ENST00000497019 2508 ntTSL 219.93■□□□□ 0.786e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ALKBH6-214ENST00000490483 861 ntTSL 519.69■□□□□ 0.742e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.742e-11■■■□□ 19
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