Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RESTQ13127 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RESTQ13127 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RESTQ13127 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RESTQ13127 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RESTQ13127 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RESTQ13127 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RESTQ13127 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RESTQ13127 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RESTQ13127 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RESTQ13127 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RESTQ13127 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RESTQ13127 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RESTQ13127 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RESTQ13127 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RESTQ13127 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RESTQ13127 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RESTQ13127 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RESTQ13127 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RESTQ13127 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RESTQ13127 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RESTQ13127 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RESTQ13127 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RESTQ13127 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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RESTQ13127 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RESTQ13127 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RESTQ13127 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RESTQ13127 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RESTQ13127 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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RESTQ13127 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RESTQ13127 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RESTQ13127 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RESTQ13127 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RESTQ13127 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RESTQ13127 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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RESTQ13127 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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RESTQ13127 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RESTQ13127 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RESTQ13127 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RESTQ13127 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RESTQ13127 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RESTQ13127 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RESTQ13127 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RESTQ13127 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RESTQ13127 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RESTQ13127 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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RESTQ13127 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RESTQ13127 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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