Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHAF1BQ13112 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHAF1BQ13112 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms