Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM32Q13049 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM32Q13049 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM32Q13049 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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TRIM32Q13049 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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TRIM32Q13049 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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TRIM32Q13049 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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TRIM32Q13049 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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TRIM32Q13049 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM32Q13049 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM32Q13049 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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