Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
PRDM2Q13029 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRDM2Q13029 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
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