Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BNIP3Q12983 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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