Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CGNL1Q0VF96 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CGNL1Q0VF96 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms