Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RIPPLY1Q0D2K3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RIPPLY1Q0D2K3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms