Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD300CQ08708 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD300CQ08708 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms