Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PUDPQ08623 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms