Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDR1Q08345 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DDR1Q08345 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms