Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EXOSC9Q06265 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms